تعتبر إدارة القياس والمعاييرة من الإدارات الرئيسية للهيئة ولقد كانت تتبع الي وزارة التجارة سابقا منذ إنشائها عام 1952م كقسم للموازين والمقاييس في الوزارة ولقد مرت بمراحل توسع في خدمات الموازين والمقاييس وإستحدث قسم دمغ المصوغات الذي صدر قرار إنشائه في عام 1972م وإفتتاحه في أكتوبر 1985م وتطورت تشريعاتها علي المستوى القومي حيث أصبحت إدارة عامة للموازين ودمغ المصوغات والتي إنضمت إلى الهيئة في عام 1994م وتبعتها مكاتب الموازين والمقاييس بالولايات عام 2002م وتم تجديد القوانين الحاكمة لعمل الإدارة لتتماشى مع التطورات والتغييرات عام 2008م وتم تزويد وحدة مختبرات المعايرة بعدد أربعة مختبرات جديدة لتكملة منظومة المعايرة وذلك في عام 2015م ويتم تزويد الإدارة بكوادر مؤهلة طوال فترات التطور المتعاقبة مما أدى إلى إحداث نقلة نوعية في عمليات المعايرة بالسودان ومواكبة التطورات العالمية في مجالات المترولوجيا.
يفوض المديرالعام للهيئة السودانية للمواصفات والمقاييس إدارة القياس والمعايرة بالإختصاصات الآتية:
تطبق أنشطة المترولوجيا على سائر العمليات الإنتاجية والخدمية حيث لها تأثير واسع جداً على كل جوانب الحياة (التجارة، الصناعة، الزراعة، الصحة، البيئة والسلامة...إلخ). حيث ان الدقة في الإنتاج الصناعي والعمليات، وموثوقية التشخيص الطبي، وسلامة الدواء والغذاء، والرصد البيئي، والثقة في جودة البيانات والعديد من التطبيقات الأخرى تعتمد على القياسات الصحيحة القابلة للتكرار والقابلة للتتبع (الإسناد الدولي) مما يستلزم دعامة مترولوجية قوية.
تلعب المترولوجيا دور رئيسي في تبني العلوم والتكنولوجيا والإبتكار وتصميم وتصنيع المنتجات التي تتوافق مع إحتياجات السوق بكفاءة، وكشف وتجنب عدم المطابقة ودعم الجودة في السلع المصنعة إستناداً على وحدات قياس موحدة وأجهزة ومعدات قياس ذات مصداقية وموثقية ومرجعية عالمية. كما توفر المترولوجيا التجارة العادلة في الإقتصاد المحلي والتجارة الدولية في الأسواق العالمية. وهنالك العديد من التطبيقات المترولوجية التي لها الجانب القانوني في مجالات التجارة والصحة والسلامة والبيئة.
بالإضافة لأنشطة القياس والمعايرة تقوم الإدارة بتطبيق قانون المعادن النفيسة والأحجار الكريمة على جميع المشغولات والسبائك الذهبية وذلك لتحديد العيار وختم المصوغ أو السبيكة حماية للمستهلك وتنظيماً لتجارة المعادن النفيسة والأحجار الكريمة ودفعاً للإقتصاد في مجالات إستخراج المعادن النفيسة.
تطبق ادارة القياس والمعايرة نظامين لادارة جودة العمليات هما: